化学清洗主要是利用清洗液清洗冷凝器，先用酸溶液进行清洗，然后用碱溶液中和清洗，再用清水冲洗，将酸、碱溶液冲干净。

1、可以在清洗贮液槽与冷凝器之间接上循环泵和管道，形成一个循环，使清洗液不断循环12—24小时，使水垢等沉积物溶解、脱落；

2、可以用清洗液加水以一定比例加入冷却水系统中，开启冷却泵循环12—24小时，沉积物层在不断受到清洗液的化学作用和冲刷作用下会溶解和脱落。不过这种方法需要大量清洗药水和水，成本较高；

3、将清洗液按一定比例兑好，加入冷凝器中静置5—10小时，使沉积物软化、溶解，排掉清洗液，用清水冲刷。

化学清洗的优点是除垢彻底，减轻工人的工作量，而缺点是清洗液可能对冷凝器铜管造成腐蚀，清洗后的废液排放问题，清洗液的价格比较贵。